La sous-direction du Littoral de l'INPC englobe les provinces de Esmeraldas, Manabí, Los Ríos, El Oro, Santa Elena, Guayas et Galápagos. Son plan pour 2009 se concentrera essentiellement autour de l'inventaire des sites de la région côtière, tâche qui sera menée à bien aux côtés du Conah.

D'autre part, les objets mis au jour et/ou inventoriés seront restaurés et étudiés. Le Directeur de l'INPC du Littoral, Alfredo Moreira, a en outre signalé que des mesures de prévention seront prises pour protéger les sites archéologiques de sa juridiction des risques liés à la saison des pluies. Une attention toute particulière sera accordée aux sites Hacienda María (nord de Guayaquil), et aux sites de la communauté Valdivia.

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